项目基本情况Basic information of the project
从已发表文献中收集了经各种生物学实验验证的代谢综合征及其特征疾病相关的非编码RNA并构建了一个专门的数据库ncRNA2MetS,其中包括与T2DM相关的miRNAs 207个和lncRNAs 28个。构建了代谢综合征相关的lncRNA-miRNA-mRNA网络,识别与代谢综合征相关的lncRNA XIST,RT-qPCR实验结果表明在代谢综合征患者的外周血单核细胞中,XIST和PTEN的相对表达量明显降低(P<0.05),miR-214-3p的相对表达量明显增加(P<0.05),意味着PTEN和XIST可能通过竞争结合miR-214-3p在代谢综合征患者中发挥基因调控作用。提出了一种基于随机森林的lncRNA-disease关联预测算法,5折交叉验证下的AUC值和AUPR值及3种癌症上的案例研究表明该算法的性能优于现有的杰出的lncRNA-disease关联预测算法,利用该算法预测了T2DM相关的前50个lncRNAs。提出了一种改进的基于随机森林的miRNA-disease关联预测算法,留一法交叉验证和5折交叉验证下的AUC值和3种癌症上的案例研究表明该算法的性能优于已有的优秀miRNA-disease关联预测算法,利用该算法预测了T2DM相关的前50个miRNAs。基于本项目,在项目执行期内成功申请软件著作权1项,发表SCI期刊论文4篇。
管理团队与技术团队Management team and technical team
哈尔滨理工大学
效益分析Benefit analysis
该项目为储备库项目资源,暂无效益分析内容。