本研究分别对类风湿关节炎患者组30例患者、健康对照组30例的血样及于相关抗体、病情活动度进行研究，筛选出的感兴趣的lncRNA 进行验证，同时进一步行生物信息学分析。使用乙二胺四乙酸(ethylenediamine tetracetic acid, EDTA)抗凝管采集研究对象的外周静脉血。运用Ficoll密度梯度离心分离人PBMCs，样品合格后分装保存于-80 ℃冰箱。通过生物信息学分析，从Array Express database中选择与RA相关的mRNAs与从候选lnc-RNA mRNA相互作用中选择mRNA的交集，得到候选lnc-RNA和与RA相关的mRNA的表达谱，进一步研究lncRNA-mRNA之间的共表达关系，以识别lncRNAs竞争调控的子通路，预测lncRNA在疾病状态下的功能。应用领域：本研究对于识别具有生物学意义的子通路是有效的，通过识别子通路可以发挥在类风湿关节炎中重要作用的lnc-RNA，因此该研究不仅有助于研究RA的分子机制，也有助于探索lnc-RNA在病理状态下的功能作用、与RA患者ACPA及病情活动度之间存在关系，这些位点的基因变异有望用来判断患者的病情程度。 技术原理：采集患者及健康者血清冻存，先通过从Array Express database中选择与RA相关的mRNAs与从候选lnc-RNA mRNA相互作用中选择mRNA的交集，得到候选lnc-RNA和与RA相关的mRNA的表达谱，在患者及健康者血清中针对于RA相关表达谱进行进一步研究lncRNA-mRNA之间的共表达关系对及与RA相关指标的关系。然后将候选基因组合中lnc-RNAs调控的mRNA嵌入到KEGG数据库中获得的候选差异通路中，从而获得lnc-RNA竞争性调控的信号通路。lncRNA的失调可能通过调节路径下的不同区域来影响疾病的发展。建立与失调的lncRNAs相关的子通路可能有助于探索lncRNAs作用于疾病状态的机制。 在本工作中，整合转录表达lncRNA-mRNAs关联网络和通路拓扑，以识别lncRNAs竞争调控的子通路，预测lncRNA在疾病状态下的功能。一些与RA相关的关键lncRNA可以通过鉴定lncRNA竞争性调节的子路径来检测。

齐齐哈尔市第一医院

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