本课题来源为黑龙江省科技厅。课题研究对象为生存在内蒙古达里湖中能适应湖中高达54mmmol/L碱度环境的瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii)碱水种群。瓦氏雅罗鱼是一种广盐性淡水鱼类，在许多淡水河流和湖泊中有广泛分布。达里湖中生存的特殊种群因对极端高碱的耐受性而受到学者关注，但其高碱耐受的生理机制尚不清楚。 目前对瓦氏雅罗鱼碱水种群高碱适应机制的研究仍主要集中于筛选和鉴定与这种适应相关的功能基因上。转录组学分析发现，在瓦氏雅罗鱼碱水群体适应高碱的酸碱平衡调节过程中，大量参与离子转运和花生四烯酸代谢途径的基因表达量出现显著变化（P<0.5）。以往研究发现基因组水平上对高碱环境的适应性调节范围有限，而大量研究证明表观遗传调控可以帮助生物体在不改变DNA序列的情况下快速应答以适应外界胁迫环境，因此推测瓦氏雅罗鱼碱水种群对高碱耐受的适应可能是从表观遗传学水平上实现的。长链非编码RNAs (Long non-coding RNAs, lncRNAs)是一类新兴的表观遗传调控分子，在基因表达调控中发挥重要作用。肾脏和鳃是负责调节广盐性硬骨鱼体内渗透环境动态平衡最重要的器官。因此，本课题对不同碱度下持续胁迫20天后采集的瓦氏雅罗鱼碱水种群鳃和肾组织进行高通量测序，筛选差异表达的lncRNAs，以进一步探索lncRNAs在高碱适应过程中的潜在作用。 对lncRNAs转录本进行差异表达分析，在鳃中共发现显著差异表达的lncRNAs转录本5244个，肾中发现6571个。与lncRNAs表达模式相关的编码基因的GO和KEGG富集，GO分析表明，大量lncRNAs富集于"转运蛋白活性"、"对刺激的反应"、"结合"等条目，KEGG结果分析进一步显示代谢途径明显丰富，如："代谢途径"、"碳代谢途径"等途径被显著富集。我们随机选择16个lncRNAs转录本进行RT-qPCR检测，验证结果与测序结果趋势一致。本课题发现大量与显著差异表达lncRNAs表达模式相关的编码基因与酸碱平衡、离子转运和氨氮排泄等调节密切相关，表明lncRNAs对相关基因的调控在瓦氏雅罗鱼的高碱适应过程中可能起到重要作用。项目刚刚完成，尚未产生经济效益或进行奖项申请等工作。

中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

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