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利用深度测序（small RNA deep sequencing）技术鉴定马铃薯主要病毒及类病毒的研究与应用

发布时间： 2023-12-08 浏览量：19

交易方式：面议
联系电话：13796639125
单位名称或姓名：吕典秋
产业领域：创意设计
成果类型：

项目基本情况Basic information of the project

黑龙江省农业科学院植物脱毒苗木研究所与美国农业部农业研究中心（USDA-ARS）及中国农业科学院植物保护研究所分子病毒组合作，开展了利用小RNA深度测序（第二代测序）技术鉴定马铃薯已知、未知病毒、类病毒的技术研究。通过对不同测序数据量、是否保留寄主RNA、生物信息学分析参数设定、混合样本、叶片和块茎鉴定结果的比较等方面的研究，并利用常规检测技术对其分析结果进行了验证，筛选出了成本较低的测序方法，降低了鉴定成本，同时找到了适于病毒、类病毒分析的软件系统。通过研究还发现，利用该技术可以对休眠马铃薯块茎直接进行检测，检测结果与用叶片检测的结果无明显差异，从而省去了块茎催芽、播种等技术环节，节约了时间成本。该项目通过大量的研究，最终建立了"利用深度测序技术鉴定马铃薯已知、未知病毒、类病毒"的技术体系，并撰写了技术规程。该体系可一次性检测多个甚至所有的已知及未知的病毒及类病毒。利用该技术体系首次对黑龙江省的马铃薯田进行了针对性普查，发现马铃薯Y病毒、马铃薯纺锤块茎类病毒、马铃薯H病毒在黑龙江省发生非常普遍。利用小RNA（sRNA）深度测序结合生物信息学分析技术可一次性检测多种甚至全部的马铃薯病毒、类病毒，具有常规的检测技术无法比拟的优点。该技术体系的建立可从根本上解决马铃薯种薯质量控制问题，不仅可以检测到国家标准中规定的病毒、类病毒，还可以检测到其他的侵染马铃薯的病毒、类病毒，更好地控制马铃薯种薯的质量。该技术若推广应用，可提高马铃薯单产20%左右，仅哈尔滨地区每年就可增加社会效益1440万元。该技术若推广到整个黑龙江省，每年可减少损失4.8亿元以上。

管理团队与技术团队Management team and technical team

黑龙江省农业科学院植物脱毒苗木研究所

效益分析Benefit analysis

该项目为储备库项目资源，暂无效益分析内容。

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