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黄芪内生菌液诱导下黄芪基因调控网络的构建
发布时间: 2023-12-08 浏览量:19
  • 交易方式:面议
  • 联系电话:0451-82193039
  • 单位名称或姓名:耿欣
  • 产业领域:生物经济
  • 成果类型:
项目基本情况Basic information of the project
黄芪是中国北方的重要药用植物,广泛应用于临床配方,具有强心、抗心肌缺血、提高免疫力、降糖、抗衰老、保护脏器等多种药理作用。黄芪的药效活性成分属于次生代谢途径的产物,次生代谢途径的研究和调控是提高黄芪生物活性物质成分的有效手段,由于缺乏基因组和转录组数据,黄芪具有生物活性的次生代谢物质合成途径未知。关键基因和基因表达调控因子的研究对理解次生代谢合成途径具有重要意义。本研究利用454/Roche GS FLX测序技术对黄芪进行了de novo深度测序,对黄芪转录水平的生物信息进行了研究,对黄芪转录组代谢基因表达情况进行了分析,以便为寻找黄芪次生代谢途径及其相关限速基因和调控因子奠定了基础。 课题进行了黄芪转录组测序质量检测;黄芪转录组数据基本分析;转录组SSR位点分析;转录组基因模型预测。研究结果表明通过对黄芪(Astragalus membranaceus)进行454/Roche GS FLX技术深度测序,共得到9893条unigene,参与黄芪生物活性物质代谢的多糖代谢途径中找到36条unigene,皂苷和黄酮相关的代谢途径中找到68条相关的unigene。黄芪转录组具有高丰度,且类型丰富的SSR位点。利用全基因组测序的豆科模式植物大豆(Glycine max)、蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)、百脉根(Lotus japonicus)的基因组序列作参考对黄芪(Astragalus membranaceus)转录组进行基因模型预测分析。
管理团队与技术团队Management team and technical team
黑龙江中医药大学
效益分析Benefit analysis
该项目为储备库项目资源,暂无效益分析内容。
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