本项目首先发展miRNA功能网络的构建方法，并在此基础上研究多角度的miRNA与疾病的关联预测方法。首先，miRNA间功能相似性值是构建miRNA功能网络的基础。计算两个miRNA间功能相似性不仅与其关联的两组疾病间语义相似信息有关，而且与疾病间表型相似信息相关。因此，本项目通过融合疾病表型信息，并结合疾病有向无环图中疾病描述术语的信息含量，研究了准确计算miRNA功能相似性的方法，进而建立得到更加合理的miRNA功能网络。 其次，对于一个有已知miRNA关联的疾病，在功能网络中存在两类结点：一类是已知与该疾病关联的miRNA结点（已知结点）；另一类是当前尚未有实验证实与该疾病关联的miRNA结点（未知结点），此类结点组成的集合可以作为与该疾病关联的候选集。已知结点集和未知结点集蕴含了着丰富的先验信息，因此本项目基于先验信息提出了新的基于随机游走的预测方法，从而系统地预测网络中miRNA结点与给定疾病的关联。 第三，对于当前没有任何miRNA与之关联的疾病，除了原有的miRNA功能网络外，引入疾病结点组成的网络，建立miRNA和疾病的双层网络。该类疾病没有相关的miRNA信息，因此结合其它疾病与miRNA关联信息、miRNA相似信息、疾病相似信息，来推测该疾病与各miRNA的关联分值。本项目结合多种信息及其关联性，提出了基于矩阵分解的方法来预测此类疾病的miRNA候选。 第四，面向miRNA家族（分簇）相关的疾病候选预测，除了考虑miRNA相似信息、疾病相似信息、miRNA与疾病关联信息，还需要考虑miRNA家族成员间的信息、双层网络的局部拓扑信息。此外，miRNA网络和疾病网络的信息侧重亦不相同，需要为其分配不同的权重。为此，提出了在双层网络中有重启的单向随机游走的方法，在建立预测模型时整合以上多种信息及其各自的权重，取得了可靠的家族和分簇相关的疾病候选。

黑龙江大学

该项目为储备库项目资源，暂无效益分析内容。